GTP bağlayıcı proteinlerden ARF1 ve SAR1'in Medicago truncatula bitki türünde incelenmesi

Abstract

Hücre içi salgı yolu Endoplazmik Retikulum (ER) ve Golgi ağını kapsar. Bu iki organel arasındaki taşınım COP örtülü vesiküller aracılığı ile gerçekleştirilir. ARF1, COPI örtülü vesiküller tarafından Golgi keseciklerinden ER' a ve Golgi kesecikleri arasındaki geri yönlü taşınımında önemli rol oynar. SARİ COPU örtülü vesiküllerin oluşumuna katılır ve kargonun ER' dan Golgi keseciklerine taşınımına aracılık eder. ARFl ve SARİ proteinlerinin bitki hücrelerindeki işlevleri ile ilgili yeterli bilgi bulunmamaktadır. Bu çalışmada, Baklagil (Leguminosae) bitkileri ile yapılan moleküler biyoloji çalışmalarında model bitki olarak bilinen Medicago truncatula kullanıldı. Medicago truncatula' da farklı gelişim evrelerinde, farklı bitki kısımlarında ve nodul oluşumuna bağlı ARFl ve SARİ proteinlerinin düzeyleri incelendi. Farklı bitki kısımlarına ait protein örnekleri SDS-PAGE yöntemi ile ayrıştırılarak PVDF membrana aktarıldı. ARFl ve SARİ proteinlerinin incelenmesi immünolojik belirleme yöntemi ile gerçekleştirildi, immünolojik belirlemede Arabidopsis thaliana ARFl ve SARİ proteinlerine karşı geliştirilmiş olan antikorlar kullanıldı. SARİ protein düzeyinin nodüllü köklerde nodülsüz olanlara göre daha yüksek olduğu belirlendi. Rhizobium kültürü bulunan toprakta yetiştirilmiş olan 2.5 aylık bitkilerin farklı kısımlarında yapılan incelemede köklerde SARİ düzeyinin yaprak ve gövde kısımlarına oranla daha fazla olduğu saptandı. Bununla birlikte 3.5 aylık bitkilerin nodul ve kök kısımlarındaki SARİ protein düzeyinin eşit olduğu belirlendi. Farklı gelişim evrelerinde, farklı bitki kısımlarında ve nodul gelişimine bağlı olarak ARFl protein düzeyinde belirgin farklılıklar gözlenmedi. Bu çalışma M. truncatula' nın kök, gövde, yaprak ve nodul kısımlarında ARFl ve SARİ protein düzeylerindeki farklılıkları gösteren ilk araştırmadır.